Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAPOLAP51003 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAPOLAP51003 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAPOLAP51003 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAPOLAP51003 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAPOLAP51003 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAPOLAP51003 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms