Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL1P50553 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL1P50553 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASCL1P50553 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASCL1P50553 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASCL1P50553 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms