Protein–RNA interactions for Protein: P50221

MEOX1, Homeobox protein MOX-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEOX1P50221 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEOX1P50221 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEOX1P50221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEOX1P50221 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEOX1P50221 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MEOX1P50221 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MEOX1P50221 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms