Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP4P49662 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASP4P49662 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP4P49662 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASP4P49662 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP4P49662 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP4P49662 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP4P49662 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASP4P49662 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP4P49662 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASP4P49662 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP4P49662 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASP4P49662 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASP4P49662 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP4P49662 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP4P49662 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP4P49662 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP4P49662 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP4P49662 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP4P49662 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP4P49662 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP4P49662 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP4P49662 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP4P49662 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP4P49662 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP4P49662 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP4P49662 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP4P49662 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP4P49662 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP4P49662 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP4P49662 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP4P49662 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP4P49662 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP4P49662 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP4P49662 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP4P49662 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP4P49662 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP4P49662 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP4P49662 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP4P49662 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP4P49662 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP4P49662 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP4P49662 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP4P49662 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASP4P49662 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASP4P49662 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP4P49662 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP4P49662 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASP4P49662 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CASP4P49662 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CASP4P49662 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP4P49662 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASP4P49662 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASP4P49662 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP4P49662 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP4P49662 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP4P49662 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASP4P49662 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP4P49662 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP4P49662 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASP4P49662 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASP4P49662 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASP4P49662 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP4P49662 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP4P49662 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP4P49662 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP4P49662 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASP4P49662 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP4P49662 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASP4P49662 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP4P49662 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP4P49662 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP4P49662 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASP4P49662 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP4P49662 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP4P49662 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASP4P49662 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CASP4P49662 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CASP4P49662 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASP4P49662 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP4P49662 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP4P49662 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP4P49662 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP4P49662 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP4P49662 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP4P49662 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP4P49662 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP4P49662 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP4P49662 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP4P49662 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP4P49662 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP4P49662 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP4P49662 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP4P49662 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms