Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2AP49459 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2AP49459 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2AP49459 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms