Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCT5P48643 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT5P48643 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCT5P48643 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT5P48643 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCT5P48643 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT5P48643 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT5P48643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT5P48643 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCT5P48643 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCT5P48643 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT5P48643 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT5P48643 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCT5P48643 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCT5P48643 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCT5P48643 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT5P48643 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT5P48643 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT5P48643 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT5P48643 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCT5P48643 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT5P48643 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT5P48643 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCT5P48643 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT5P48643 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT5P48643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT5P48643 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCT5P48643 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT5P48643 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCT5P48643 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT5P48643 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT5P48643 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCT5P48643 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCT5P48643 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT5P48643 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT5P48643 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCT5P48643 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT5P48643 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT5P48643 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCT5P48643 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT5P48643 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCT5P48643 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCT5P48643 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT5P48643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT5P48643 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT5P48643 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCT5P48643 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT5P48643 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCT5P48643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT5P48643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT5P48643 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT5P48643 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCT5P48643 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT5P48643 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT5P48643 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT5P48643 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCT5P48643 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCT5P48643 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCT5P48643 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT5P48643 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT5P48643 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT5P48643 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCT5P48643 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT5P48643 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT5P48643 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT5P48643 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT5P48643 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCT5P48643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT5P48643 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT5P48643 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT5P48643 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCT5P48643 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT5P48643 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT5P48643 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT5P48643 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT5P48643 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT5P48643 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCT5P48643 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCT5P48643 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCT5P48643 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT5P48643 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT5P48643 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCT5P48643 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT5P48643 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT5P48643 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT5P48643 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCT5P48643 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms