Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEDD4P46934 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEDD4P46934 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD4P46934 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NEDD4P46934 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEDD4P46934 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEDD4P46934 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms