Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRATP43155 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRATP43155 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRATP43155 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRATP43155 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRATP43155 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRATP43155 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRATP43155 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRATP43155 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CRATP43155 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CRATP43155 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRATP43155 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRATP43155 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CRATP43155 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRATP43155 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRATP43155 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRATP43155 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CRATP43155 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRATP43155 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRATP43155 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRATP43155 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRATP43155 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRATP43155 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRATP43155 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRATP43155 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRATP43155 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRATP43155 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRATP43155 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRATP43155 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRATP43155 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRATP43155 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRATP43155 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRATP43155 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRATP43155 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRATP43155 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRATP43155 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRATP43155 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRATP43155 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRATP43155 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRATP43155 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRATP43155 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRATP43155 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRATP43155 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRATP43155 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRATP43155 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRATP43155 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRATP43155 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRATP43155 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRATP43155 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRATP43155 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRATP43155 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CRATP43155 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRATP43155 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRATP43155 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRATP43155 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRATP43155 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRATP43155 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRATP43155 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRATP43155 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRATP43155 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRATP43155 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRATP43155 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRATP43155 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRATP43155 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRATP43155 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRATP43155 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRATP43155 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRATP43155 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRATP43155 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRATP43155 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRATP43155 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRATP43155 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRATP43155 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRATP43155 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRATP43155 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRATP43155 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRATP43155 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRATP43155 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRATP43155 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRATP43155 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRATP43155 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRATP43155 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms