Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL35P42766 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL35P42766 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL35P42766 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL35P42766 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL35P42766 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL35P42766 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL35P42766 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL35P42766 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL35P42766 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL35P42766 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL35P42766 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL35P42766 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL35P42766 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL35P42766 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL35P42766 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL35P42766 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL35P42766 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL35P42766 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL35P42766 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL35P42766 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL35P42766 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL35P42766 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL35P42766 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL35P42766 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL35P42766 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL35P42766 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL35P42766 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPL35P42766 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPL35P42766 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL35P42766 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL35P42766 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL35P42766 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL35P42766 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL35P42766 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPL35P42766 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPL35P42766 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL35P42766 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPL35P42766 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL35P42766 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL35P42766 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL35P42766 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL35P42766 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL35P42766 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RPL35P42766 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL35P42766 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPL35P42766 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL35P42766 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL35P42766 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL35P42766 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL35P42766 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPL35P42766 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL35P42766 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL35P42766 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL35P42766 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL35P42766 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPL35P42766 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL35P42766 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL35P42766 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPL35P42766 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL35P42766 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL35P42766 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL35P42766 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL35P42766 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL35P42766 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL35P42766 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL35P42766 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL35P42766 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL35P42766 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL35P42766 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL35P42766 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL35P42766 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL35P42766 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL35P42766 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL35P42766 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL35P42766 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL35P42766 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL35P42766 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL35P42766 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL35P42766 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL35P42766 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL35P42766 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL35P42766 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL35P42766 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL35P42766 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL35P42766 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL35P42766 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL35P42766 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL35P42766 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL35P42766 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL35P42766 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL35P42766 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL35P42766 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL35P42766 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms