Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC19A1P41440 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC19A1P41440 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC19A1P41440 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC19A1P41440 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC19A1P41440 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms