Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC26A3P40879 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC26A3P40879 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC26A3P40879 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC26A3P40879 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC26A3P40879 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms