Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ETFBP38117 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ETFBP38117 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ETFBP38117 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ETFBP38117 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ETFBP38117 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ETFBP38117 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ETFBP38117 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ETFBP38117 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ETFBP38117 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ETFBP38117 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ETFBP38117 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ETFBP38117 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ETFBP38117 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ETFBP38117 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ETFBP38117 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ETFBP38117 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ETFBP38117 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ETFBP38117 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ETFBP38117 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ETFBP38117 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ETFBP38117 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ETFBP38117 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ETFBP38117 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ETFBP38117 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ETFBP38117 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ETFBP38117 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ETFBP38117 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ETFBP38117 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ETFBP38117 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ETFBP38117 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ETFBP38117 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ETFBP38117 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ETFBP38117 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ETFBP38117 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ETFBP38117 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ETFBP38117 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ETFBP38117 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ETFBP38117 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ETFBP38117 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ETFBP38117 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ETFBP38117 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ETFBP38117 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ETFBP38117 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ETFBP38117 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ETFBP38117 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ETFBP38117 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ETFBP38117 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ETFBP38117 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ETFBP38117 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ETFBP38117 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ETFBP38117 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ETFBP38117 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ETFBP38117 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ETFBP38117 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ETFBP38117 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ETFBP38117 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ETFBP38117 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ETFBP38117 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ETFBP38117 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ETFBP38117 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ETFBP38117 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ETFBP38117 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ETFBP38117 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ETFBP38117 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ETFBP38117 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ETFBP38117 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ETFBP38117 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ETFBP38117 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ETFBP38117 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ETFBP38117 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ETFBP38117 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ETFBP38117 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ETFBP38117 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ETFBP38117 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ETFBP38117 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ETFBP38117 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ETFBP38117 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ETFBP38117 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ETFBP38117 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ETFBP38117 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ETFBP38117 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ETFBP38117 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ETFBP38117 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ETFBP38117 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ETFBP38117 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ETFBP38117 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms