Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCAP37840 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCAP37840 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCAP37840 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCAP37840 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNCAP37840 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCAP37840 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCAP37840 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCAP37840 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNCAP37840 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCAP37840 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCAP37840 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCAP37840 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNCAP37840 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCAP37840 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCAP37840 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNCAP37840 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCAP37840 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCAP37840 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNCAP37840 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNCAP37840 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNCAP37840 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCAP37840 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCAP37840 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCAP37840 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNCAP37840 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCAP37840 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCAP37840 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCAP37840 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNCAP37840 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCAP37840 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNCAP37840 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCAP37840 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCAP37840 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCAP37840 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCAP37840 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNCAP37840 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCAP37840 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCAP37840 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCAP37840 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNCAP37840 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCAP37840 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCAP37840 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNCAP37840 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNCAP37840 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNCAP37840 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCAP37840 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNCAP37840 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCAP37840 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNCAP37840 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCAP37840 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNCAP37840 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNCAP37840 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNCAP37840 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SNCAP37840 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCAP37840 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCAP37840 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNCAP37840 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCAP37840 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCAP37840 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCAP37840 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCAP37840 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCAP37840 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNCAP37840 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCAP37840 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNCAP37840 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCAP37840 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCAP37840 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCAP37840 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCAP37840 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCAP37840 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNCAP37840 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCAP37840 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNCAP37840 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCAP37840 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCAP37840 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNCAP37840 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCAP37840 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCAP37840 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCAP37840 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNCAP37840 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCAP37840 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCAP37840 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNCAP37840 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNCAP37840 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNCAP37840 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCAP37840 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCAP37840 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNCAP37840 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCAP37840 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCAP37840 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNCAP37840 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCAP37840 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCAP37840 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCAP37840 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCAP37840 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNCAP37840 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCAP37840 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCAP37840 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNCAP37840 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms