Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACVR1BP36896 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACVR1BP36896 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACVR1BP36896 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVR1BP36896 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1BP36896 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms