Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL4P36578 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL4P36578 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL4P36578 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPL4P36578 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL4P36578 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL4P36578 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL4P36578 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPL4P36578 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL4P36578 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPL4P36578 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL4P36578 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPL4P36578 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL4P36578 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL4P36578 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL4P36578 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPL4P36578 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL4P36578 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL4P36578 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPL4P36578 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL4P36578 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL4P36578 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL4P36578 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPL4P36578 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL4P36578 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL4P36578 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL4P36578 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL4P36578 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPL4P36578 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL4P36578 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL4P36578 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL4P36578 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPL4P36578 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPL4P36578 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL4P36578 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL4P36578 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPL4P36578 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL4P36578 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL4P36578 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL4P36578 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL4P36578 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL4P36578 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL4P36578 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL4P36578 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL4P36578 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL4P36578 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL4P36578 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL4P36578 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL4P36578 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL4P36578 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL4P36578 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL4P36578 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL4P36578 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL4P36578 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL4P36578 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL4P36578 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL4P36578 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL4P36578 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL4P36578 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL4P36578 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL4P36578 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL4P36578 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL4P36578 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL4P36578 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL4P36578 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL4P36578 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL4P36578 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL4P36578 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL4P36578 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL4P36578 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL4P36578 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL4P36578 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL4P36578 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL4P36578 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL4P36578 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL4P36578 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL4P36578 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL4P36578 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL4P36578 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL4P36578 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL4P36578 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL4P36578 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL4P36578 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL4P36578 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL4P36578 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms