Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CBSP35520 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBSP35520 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBSP35520 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBSP35520 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSP35520 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSP35520 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSP35520 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSP35520 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBSP35520 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBSP35520 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CBSP35520 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBSP35520 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSP35520 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSP35520 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSP35520 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSP35520 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSP35520 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBSP35520 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBSP35520 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CBSP35520 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBSP35520 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBSP35520 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBSP35520 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBSP35520 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBSP35520 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBSP35520 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBSP35520 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBSP35520 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBSP35520 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBSP35520 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBSP35520 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSP35520 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSP35520 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSP35520 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSP35520 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBSP35520 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBSP35520 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CBSP35520 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBSP35520 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBSP35520 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBSP35520 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBSP35520 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBSP35520 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBSP35520 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBSP35520 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSP35520 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSP35520 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSP35520 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSP35520 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBSP35520 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSP35520 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSP35520 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSP35520 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSP35520 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBSP35520 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBSP35520 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSP35520 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSP35520 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSP35520 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSP35520 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSP35520 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSP35520 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSP35520 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSP35520 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSP35520 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSP35520 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBSP35520 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBSP35520 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBSP35520 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBSP35520 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBSP35520 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSP35520 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSP35520 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSP35520 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSP35520 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSP35520 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSP35520 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSP35520 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSP35520 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSP35520 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSP35520 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBSP35520 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBSP35520 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBSP35520 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBSP35520 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBSP35520 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBSP35520 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBSP35520 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBSP35520 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSP35520 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSP35520 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSP35520 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSP35520 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSP35520 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBSP35520 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBSP35520 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSP35520 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSP35520 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSP35520 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms