Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF2P35227 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCGF2P35227 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCGF2P35227 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF2P35227 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms