Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA4P35212 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA4P35212 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA4P35212 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA4P35212 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA4P35212 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA4P35212 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA4P35212 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA4P35212 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA4P35212 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA4P35212 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA4P35212 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA4P35212 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA4P35212 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA4P35212 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA4P35212 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA4P35212 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA4P35212 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA4P35212 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA4P35212 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA4P35212 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA4P35212 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA4P35212 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA4P35212 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA4P35212 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA4P35212 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA4P35212 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA4P35212 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA4P35212 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA4P35212 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA4P35212 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA4P35212 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA4P35212 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA4P35212 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA4P35212 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJA4P35212 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA4P35212 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA4P35212 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJA4P35212 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJA4P35212 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA4P35212 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJA4P35212 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJA4P35212 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA4P35212 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJA4P35212 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA4P35212 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA4P35212 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJA4P35212 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJA4P35212 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA4P35212 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA4P35212 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJA4P35212 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJA4P35212 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA4P35212 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA4P35212 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJA4P35212 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA4P35212 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA4P35212 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA4P35212 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA4P35212 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJA4P35212 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA4P35212 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA4P35212 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA4P35212 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA4P35212 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA4P35212 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJA4P35212 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA4P35212 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJA4P35212 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA4P35212 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA4P35212 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA4P35212 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA4P35212 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJA4P35212 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA4P35212 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GJA4P35212 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GJA4P35212 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA4P35212 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA4P35212 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJA4P35212 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA4P35212 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA4P35212 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA4P35212 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA4P35212 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJA4P35212 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA4P35212 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA4P35212 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA4P35212 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJA4P35212 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA4P35212 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA4P35212 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJA4P35212 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms