Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTF4P34130 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTF4P34130 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NTF4P34130 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NTF4P34130 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NTF4P34130 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTF4P34130 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTF4P34130 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTF4P34130 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTF4P34130 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTF4P34130 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NTF4P34130 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTF4P34130 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTF4P34130 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTF4P34130 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NTF4P34130 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NTF4P34130 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTF4P34130 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTF4P34130 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTF4P34130 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTF4P34130 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NTF4P34130 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NTF4P34130 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTF4P34130 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTF4P34130 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTF4P34130 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTF4P34130 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTF4P34130 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NTF4P34130 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTF4P34130 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTF4P34130 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTF4P34130 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTF4P34130 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NTF4P34130 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTF4P34130 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NTF4P34130 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NTF4P34130 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NTF4P34130 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NTF4P34130 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NTF4P34130 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTF4P34130 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NTF4P34130 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTF4P34130 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTF4P34130 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NTF4P34130 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTF4P34130 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTF4P34130 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NTF4P34130 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTF4P34130 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NTF4P34130 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NTF4P34130 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTF4P34130 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTF4P34130 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTF4P34130 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NTF4P34130 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTF4P34130 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTF4P34130 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTF4P34130 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NTF4P34130 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTF4P34130 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NTF4P34130 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NTF4P34130 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTF4P34130 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTF4P34130 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NTF4P34130 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTF4P34130 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTF4P34130 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NTF4P34130 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NTF4P34130 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTF4P34130 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NTF4P34130 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NTF4P34130 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTF4P34130 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTF4P34130 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTF4P34130 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NTF4P34130 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NTF4P34130 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NTF4P34130 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTF4P34130 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTF4P34130 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NTF4P34130 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NTF4P34130 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTF4P34130 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTF4P34130 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTF4P34130 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTF4P34130 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTF4P34130 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms