Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF8P32971 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF8P32971 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF8P32971 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF8P32971 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms