Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCKARP32238 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKARP32238 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKARP32238 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKARP32238 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKARP32238 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKARP32238 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCKARP32238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCKARP32238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCKARP32238 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCKARP32238 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCKARP32238 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCKARP32238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKARP32238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKARP32238 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKARP32238 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKARP32238 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCKARP32238 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKARP32238 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCKARP32238 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCKARP32238 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCKARP32238 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKARP32238 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCKARP32238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKARP32238 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKARP32238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKARP32238 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKARP32238 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKARP32238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCKARP32238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKARP32238 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCKARP32238 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCKARP32238 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKARP32238 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKARP32238 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCKARP32238 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKARP32238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKARP32238 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCKARP32238 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKARP32238 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCKARP32238 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKARP32238 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKARP32238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKARP32238 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKARP32238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCKARP32238 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKARP32238 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKARP32238 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKARP32238 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCKARP32238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCKARP32238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCKARP32238 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKARP32238 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKARP32238 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKARP32238 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKARP32238 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKARP32238 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKARP32238 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKARP32238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKARP32238 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKARP32238 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKARP32238 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKARP32238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKARP32238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKARP32238 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKARP32238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKARP32238 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKARP32238 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKARP32238 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKARP32238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKARP32238 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKARP32238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKARP32238 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKARP32238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKARP32238 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKARP32238 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKARP32238 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKARP32238 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKARP32238 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKARP32238 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCKARP32238 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCKARP32238 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKARP32238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKARP32238 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCKARP32238 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKARP32238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKARP32238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKARP32238 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKARP32238 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKARP32238 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms