Protein–RNA interactions for Protein: P30531

SLC6A1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A1P30531 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A1P30531 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A1P30531 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A1P30531 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A1P30531 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A1P30531 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A1P30531 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms