Protein–RNA interactions for Protein: P30154

PPP2R1B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R1BP30154 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R1BP30154 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP2R1BP30154 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP2R1BP30154 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPP2R1BP30154 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP2R1BP30154 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP2R1BP30154 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms