Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD40LGP29965 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD40LGP29965 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD40LGP29965 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms