Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTGFP29279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTGFP29279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTGFP29279 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTGFP29279 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTGFP29279 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTGFP29279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTGFP29279 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CTGFP29279 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTGFP29279 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTGFP29279 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTGFP29279 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTGFP29279 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTGFP29279 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTGFP29279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CTGFP29279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTGFP29279 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTGFP29279 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CTGFP29279 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTGFP29279 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTGFP29279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTGFP29279 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CTGFP29279 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTGFP29279 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTGFP29279 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTGFP29279 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTGFP29279 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTGFP29279 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTGFP29279 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTGFP29279 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTGFP29279 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTGFP29279 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTGFP29279 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTGFP29279 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTGFP29279 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTGFP29279 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTGFP29279 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTGFP29279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTGFP29279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTGFP29279 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CTGFP29279 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTGFP29279 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CTGFP29279 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTGFP29279 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTGFP29279 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTGFP29279 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTGFP29279 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTGFP29279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTGFP29279 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTGFP29279 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTGFP29279 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTGFP29279 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTGFP29279 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTGFP29279 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTGFP29279 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTGFP29279 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTGFP29279 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTGFP29279 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTGFP29279 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTGFP29279 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTGFP29279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CTGFP29279 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CTGFP29279 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTGFP29279 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTGFP29279 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTGFP29279 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTGFP29279 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTGFP29279 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTGFP29279 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTGFP29279 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTGFP29279 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTGFP29279 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTGFP29279 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTGFP29279 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTGFP29279 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTGFP29279 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTGFP29279 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTGFP29279 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CTGFP29279 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTGFP29279 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTGFP29279 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTGFP29279 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTGFP29279 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTGFP29279 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTGFP29279 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTGFP29279 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTGFP29279 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTGFP29279 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTGFP29279 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CTGFP29279 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTGFP29279 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTGFP29279 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTGFP29279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTGFP29279 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms