Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTR1EP28566 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HTR1EP28566 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTR1EP28566 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTR1EP28566 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTR1EP28566 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms