Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCD3P28288 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCD3P28288 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCD3P28288 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ABCD3P28288 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD3P28288 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms