Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGA3P26006 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA3P26006 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA3P26006 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA3P26006 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms