Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA1P25391 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA1P25391 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA1P25391 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA1P25391 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA1P25391 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms