Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GADD45AP24522 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GADD45AP24522 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GADD45AP24522 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GADD45AP24522 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GADD45AP24522 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms