Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND1P24385 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCND1P24385 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND1P24385 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND1P24385 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND1P24385 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND1P24385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND1P24385 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCND1P24385 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCND1P24385 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND1P24385 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCND1P24385 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND1P24385 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCND1P24385 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND1P24385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND1P24385 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCND1P24385 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND1P24385 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND1P24385 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND1P24385 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND1P24385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND1P24385 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCND1P24385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND1P24385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND1P24385 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCND1P24385 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND1P24385 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND1P24385 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND1P24385 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCND1P24385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCND1P24385 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND1P24385 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND1P24385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCND1P24385 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND1P24385 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND1P24385 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCND1P24385 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND1P24385 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND1P24385 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND1P24385 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND1P24385 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND1P24385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND1P24385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND1P24385 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND1P24385 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND1P24385 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND1P24385 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND1P24385 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND1P24385 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND1P24385 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND1P24385 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND1P24385 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND1P24385 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND1P24385 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND1P24385 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND1P24385 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND1P24385 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND1P24385 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND1P24385 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND1P24385 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND1P24385 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND1P24385 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND1P24385 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND1P24385 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND1P24385 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND1P24385 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND1P24385 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND1P24385 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND1P24385 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND1P24385 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCND1P24385 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCND1P24385 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND1P24385 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND1P24385 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND1P24385 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND1P24385 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND1P24385 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND1P24385 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND1P24385 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND1P24385 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCND1P24385 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCND1P24385 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND1P24385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND1P24385 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCND1P24385 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND1P24385 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCND1P24385 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCND1P24385 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND1P24385 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND1P24385 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCND1P24385 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND1P24385 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND1P24385 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCND1P24385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms