Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGS1P23219 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTGS1P23219 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTGS1P23219 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTGS1P23219 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTGS1P23219 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTGS1P23219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTGS1P23219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms