Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LMNB1P20700 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
LMNB1P20700 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMNB1P20700 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMNB1P20700 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
LMNB1P20700 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LMNB1P20700 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMNB1P20700 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms