Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM21P19474 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM21P19474 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM21P19474 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM21P19474 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM21P19474 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM21P19474 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms