Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
VCAM1P19320 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
VCAM1P19320 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VCAM1P19320 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VCAM1P19320 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VCAM1P19320 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VCAM1P19320 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
VCAM1P19320 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms