Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTPS1P17812 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTPS1P17812 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTPS1P17812 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTPS1P17812 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms