Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SELPP16109 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SELPP16109 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SELPP16109 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SELPP16109 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SELPP16109 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SELPP16109 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SELPP16109 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SELPP16109 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SELPP16109 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SELPP16109 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SELPP16109 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SELPP16109 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SELPP16109 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SELPP16109 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SELPP16109 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SELPP16109 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SELPP16109 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SELPP16109 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SELPP16109 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SELPP16109 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SELPP16109 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SELPP16109 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SELPP16109 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SELPP16109 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SELPP16109 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SELPP16109 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SELPP16109 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SELPP16109 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SELPP16109 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SELPP16109 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SELPP16109 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SELPP16109 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SELPP16109 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SELPP16109 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SELPP16109 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SELPP16109 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SELPP16109 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SELPP16109 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SELPP16109 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SELPP16109 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SELPP16109 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SELPP16109 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SELPP16109 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SELPP16109 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SELPP16109 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SELPP16109 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SELPP16109 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SELPP16109 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SELPP16109 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SELPP16109 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SELPP16109 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SELPP16109 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SELPP16109 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SELPP16109 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SELPP16109 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SELPP16109 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SELPP16109 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SELPP16109 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SELPP16109 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SELPP16109 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SELPP16109 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SELPP16109 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SELPP16109 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SELPP16109 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SELPP16109 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SELPP16109 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELPP16109 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELPP16109 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELPP16109 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELPP16109 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SELPP16109 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELPP16109 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELPP16109 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SELPP16109 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SELPP16109 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SELPP16109 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SELPP16109 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SELPP16109 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SELPP16109 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SELPP16109 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SELPP16109 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SELPP16109 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SELPP16109 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SELPP16109 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SELPP16109 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SELPP16109 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SELPP16109 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SELPP16109 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SELPP16109 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SELPP16109 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SELPP16109 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SELPP16109 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SELPP16109 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SELPP16109 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SELPP16109 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SELPP16109 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SELPP16109 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SELPP16109 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SELPP16109 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms