Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA2P15927 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA2P15927 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA2P15927 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA2P15927 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA2P15927 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RPA2P15927 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA2P15927 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA2P15927 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPA2P15927 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA2P15927 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPA2P15927 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA2P15927 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA2P15927 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA2P15927 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA2P15927 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA2P15927 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPA2P15927 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA2P15927 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPA2P15927 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA2P15927 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA2P15927 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPA2P15927 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPA2P15927 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA2P15927 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA2P15927 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA2P15927 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA2P15927 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA2P15927 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA2P15927 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA2P15927 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA2P15927 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA2P15927 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA2P15927 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA2P15927 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA2P15927 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA2P15927 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA2P15927 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA2P15927 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA2P15927 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA2P15927 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA2P15927 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA2P15927 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA2P15927 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA2P15927 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA2P15927 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA2P15927 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA2P15927 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPA2P15927 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA2P15927 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA2P15927 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA2P15927 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA2P15927 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPA2P15927 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA2P15927 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA2P15927 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPA2P15927 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA2P15927 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPA2P15927 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA2P15927 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA2P15927 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPA2P15927 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA2P15927 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA2P15927 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA2P15927 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPA2P15927 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA2P15927 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPA2P15927 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPA2P15927 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA2P15927 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA2P15927 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA2P15927 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPA2P15927 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA2P15927 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA2P15927 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA2P15927 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPA2P15927 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPA2P15927 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA2P15927 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA2P15927 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA2P15927 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA2P15927 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPA2P15927 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA2P15927 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA2P15927 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA2P15927 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPA2P15927 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA2P15927 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms