Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RAG1P15918 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAG1P15918 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAG1P15918 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAG1P15918 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAG1P15918 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAG1P15918 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAG1P15918 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAG1P15918 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAG1P15918 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAG1P15918 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAG1P15918 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAG1P15918 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAG1P15918 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAG1P15918 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAG1P15918 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAG1P15918 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAG1P15918 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RAG1P15918 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAG1P15918 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAG1P15918 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAG1P15918 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAG1P15918 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAG1P15918 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAG1P15918 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAG1P15918 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAG1P15918 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAG1P15918 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAG1P15918 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAG1P15918 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAG1P15918 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAG1P15918 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAG1P15918 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAG1P15918 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAG1P15918 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAG1P15918 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAG1P15918 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAG1P15918 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAG1P15918 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAG1P15918 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAG1P15918 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAG1P15918 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAG1P15918 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAG1P15918 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAG1P15918 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAG1P15918 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAG1P15918 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RAG1P15918 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAG1P15918 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAG1P15918 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAG1P15918 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAG1P15918 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAG1P15918 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAG1P15918 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAG1P15918 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAG1P15918 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RAG1P15918 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAG1P15918 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAG1P15918 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAG1P15918 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAG1P15918 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAG1P15918 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAG1P15918 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAG1P15918 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RAG1P15918 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAG1P15918 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAG1P15918 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAG1P15918 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAG1P15918 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAG1P15918 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAG1P15918 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAG1P15918 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAG1P15918 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAG1P15918 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAG1P15918 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAG1P15918 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAG1P15918 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAG1P15918 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAG1P15918 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAG1P15918 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RAG1P15918 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAG1P15918 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAG1P15918 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAG1P15918 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAG1P15918 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAG1P15918 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAG1P15918 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAG1P15918 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAG1P15918 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAG1P15918 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAG1P15918 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAG1P15918 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAG1P15918 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAG1P15918 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAG1P15918 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAG1P15918 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAG1P15918 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAG1P15918 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAG1P15918 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAG1P15918 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms