Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKIP12755 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKIP12755 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKIP12755 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SKIP12755 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKIP12755 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIP12755 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIP12755 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIP12755 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIP12755 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIP12755 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIP12755 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIP12755 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIP12755 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKIP12755 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKIP12755 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIP12755 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIP12755 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIP12755 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIP12755 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIP12755 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIP12755 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKIP12755 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKIP12755 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIP12755 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIP12755 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIP12755 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIP12755 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKIP12755 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIP12755 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKIP12755 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKIP12755 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIP12755 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKIP12755 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKIP12755 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SKIP12755 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIP12755 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIP12755 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SKIP12755 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SKIP12755 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKIP12755 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SKIP12755 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIP12755 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIP12755 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIP12755 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIP12755 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SKIP12755 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIP12755 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIP12755 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIP12755 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIP12755 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SKIP12755 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIP12755 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SKIP12755 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SKIP12755 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SKIP12755 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SKIP12755 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SKIP12755 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIP12755 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIP12755 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIP12755 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SKIP12755 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKIP12755 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SKIP12755 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKIP12755 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKIP12755 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SKIP12755 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SKIP12755 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SKIP12755 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKIP12755 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SKIP12755 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SKIP12755 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIP12755 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIP12755 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIP12755 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SKIP12755 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SKIP12755 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIP12755 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIP12755 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIP12755 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SKIP12755 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SKIP12755 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKIP12755 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKIP12755 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SKIP12755 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIP12755 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIP12755 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIP12755 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIP12755 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIP12755 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SKIP12755 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIP12755 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms