Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCKDHAP12694 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCKDHAP12694 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCKDHAP12694 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCKDHAP12694 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCKDHAP12694 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BCKDHAP12694 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BCKDHAP12694 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms