Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL6A2P12110 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
COL6A2P12110 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL6A2P12110 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL6A2P12110 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms