Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
LAMC1P11047 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
LAMC1P11047 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
LAMC1P11047 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LAMC1P11047 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
LAMC1P11047 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
LAMC1P11047 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms