Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAR1AP10644 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAR1AP10644 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAR1AP10644 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKAR1AP10644 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAR1AP10644 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms