Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBSLP0DN79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBSLP0DN79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBSLP0DN79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBSLP0DN79 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBSLP0DN79 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms