Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MMP10P09238 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MMP10P09238 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MMP10P09238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MMP10P09238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MMP10P09238 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MMP10P09238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MMP10P09238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MMP10P09238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MMP10P09238 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
MMP10P09238 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MMP10P09238 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
MMP10P09238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MMP10P09238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MMP10P09238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MMP10P09238 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MMP10P09238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MMP10P09238 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MMP10P09238 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MMP10P09238 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MMP10P09238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MMP10P09238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MMP10P09238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MMP10P09238 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MMP10P09238 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MMP10P09238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MMP10P09238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MMP10P09238 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MMP10P09238 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MMP10P09238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MMP10P09238 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MMP10P09238 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MMP10P09238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
MMP10P09238 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MMP10P09238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MMP10P09238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MMP10P09238 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MMP10P09238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MMP10P09238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MMP10P09238 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MMP10P09238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MMP10P09238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MMP10P09238 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MMP10P09238 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MMP10P09238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MMP10P09238 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
MMP10P09238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
MMP10P09238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
MMP10P09238 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MMP10P09238 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
MMP10P09238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MMP10P09238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MMP10P09238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
MMP10P09238 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MMP10P09238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MMP10P09238 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
MMP10P09238 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MMP10P09238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MMP10P09238 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MMP10P09238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MMP10P09238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MMP10P09238 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MMP10P09238 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MMP10P09238 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MMP10P09238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MMP10P09238 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
MMP10P09238 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MMP10P09238 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MMP10P09238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MMP10P09238 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MMP10P09238 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MMP10P09238 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MMP10P09238 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MMP10P09238 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MMP10P09238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MMP10P09238 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MMP10P09238 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MMP10P09238 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MMP10P09238 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MMP10P09238 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MMP10P09238 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MMP10P09238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MMP10P09238 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MMP10P09238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MMP10P09238 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
MMP10P09238 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
MMP10P09238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MMP10P09238 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MMP10P09238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MMP10P09238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MMP10P09238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MMP10P09238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MMP10P09238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MMP10P09238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MMP10P09238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MMP10P09238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MMP10P09238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MMP10P09238 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
MMP10P09238 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MMP10P09238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms