Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD63P08962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD63P08962 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD63P08962 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD63P08962 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD63P08962 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD63P08962 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD63P08962 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD63P08962 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD63P08962 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD63P08962 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD63P08962 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD63P08962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD63P08962 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD63P08962 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD63P08962 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD63P08962 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD63P08962 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD63P08962 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD63P08962 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD63P08962 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD63P08962 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD63P08962 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD63P08962 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD63P08962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD63P08962 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD63P08962 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD63P08962 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD63P08962 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD63P08962 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD63P08962 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD63P08962 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD63P08962 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD63P08962 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD63P08962 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD63P08962 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD63P08962 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD63P08962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD63P08962 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD63P08962 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD63P08962 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD63P08962 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD63P08962 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD63P08962 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD63P08962 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD63P08962 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD63P08962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD63P08962 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD63P08962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD63P08962 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD63P08962 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD63P08962 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD63P08962 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD63P08962 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD63P08962 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD63P08962 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD63P08962 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD63P08962 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD63P08962 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD63P08962 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD63P08962 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD63P08962 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD63P08962 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD63P08962 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD63P08962 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD63P08962 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD63P08962 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD63P08962 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD63P08962 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CD63P08962 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CD63P08962 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD63P08962 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD63P08962 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD63P08962 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD63P08962 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD63P08962 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD63P08962 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD63P08962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD63P08962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD63P08962 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD63P08962 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD63P08962 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD63P08962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD63P08962 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD63P08962 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD63P08962 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD63P08962 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD63P08962 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD63P08962 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD63P08962 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms