Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NFICP08651 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NFICP08651 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NFICP08651 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFICP08651 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NFICP08651 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NFICP08651 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFICP08651 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFICP08651 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NFICP08651 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NFICP08651 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NFICP08651 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFICP08651 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFICP08651 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NFICP08651 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFICP08651 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NFICP08651 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NFICP08651 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NFICP08651 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFICP08651 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFICP08651 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NFICP08651 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFICP08651 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFICP08651 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NFICP08651 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NFICP08651 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NFICP08651 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFICP08651 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFICP08651 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NFICP08651 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NFICP08651 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NFICP08651 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFICP08651 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NFICP08651 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NFICP08651 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFICP08651 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFICP08651 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFICP08651 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NFICP08651 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NFICP08651 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFICP08651 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NFICP08651 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFICP08651 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFICP08651 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NFICP08651 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFICP08651 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NFICP08651 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFICP08651 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFICP08651 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFICP08651 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NFICP08651 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFICP08651 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFICP08651 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFICP08651 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFICP08651 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFICP08651 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFICP08651 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFICP08651 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFICP08651 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFICP08651 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFICP08651 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFICP08651 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFICP08651 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFICP08651 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFICP08651 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFICP08651 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFICP08651 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFICP08651 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFICP08651 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NFICP08651 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFICP08651 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFICP08651 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFICP08651 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFICP08651 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFICP08651 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFICP08651 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NFICP08651 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFICP08651 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFICP08651 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFICP08651 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFICP08651 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFICP08651 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFICP08651 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NFICP08651 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NFICP08651 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NFICP08651 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms