Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHP07954 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FHP07954 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FHP07954 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHP07954 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHP07954 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHP07954 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHP07954 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHP07954 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHP07954 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHP07954 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHP07954 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHP07954 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHP07954 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHP07954 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FHP07954 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FHP07954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHP07954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHP07954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHP07954 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FHP07954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FHP07954 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHP07954 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHP07954 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHP07954 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FHP07954 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FHP07954 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHP07954 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FHP07954 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHP07954 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHP07954 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FHP07954 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHP07954 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHP07954 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHP07954 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FHP07954 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FHP07954 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FHP07954 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FHP07954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FHP07954 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FHP07954 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FHP07954 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FHP07954 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FHP07954 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FHP07954 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FHP07954 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FHP07954 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FHP07954 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FHP07954 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FHP07954 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FHP07954 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FHP07954 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FHP07954 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FHP07954 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FHP07954 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FHP07954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FHP07954 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FHP07954 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FHP07954 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FHP07954 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FHP07954 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FHP07954 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHP07954 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHP07954 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHP07954 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHP07954 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FHP07954 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FHP07954 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHP07954 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FHP07954 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHP07954 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FHP07954 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHP07954 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FHP07954 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHP07954 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHP07954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHP07954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FHP07954 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FHP07954 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FHP07954 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FHP07954 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FHP07954 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FHP07954 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FHP07954 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FHP07954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FHP07954 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FHP07954 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHP07954 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FHP07954 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FHP07954 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FHP07954 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHP07954 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHP07954 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHP07954 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FHP07954 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FHP07954 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHP07954 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHP07954 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FHP07954 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FHP07954 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms