Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLK3P07288 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
KLK3P07288 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLK3P07288 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLK3P07288 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLK3P07288 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLK3P07288 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLK3P07288 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLK3P07288 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLK3P07288 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLK3P07288 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLK3P07288 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLK3P07288 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLK3P07288 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLK3P07288 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLK3P07288 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLK3P07288 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLK3P07288 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLK3P07288 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLK3P07288 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLK3P07288 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLK3P07288 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLK3P07288 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLK3P07288 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLK3P07288 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLK3P07288 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLK3P07288 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLK3P07288 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLK3P07288 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLK3P07288 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLK3P07288 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLK3P07288 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLK3P07288 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLK3P07288 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLK3P07288 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLK3P07288 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLK3P07288 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLK3P07288 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLK3P07288 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLK3P07288 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLK3P07288 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLK3P07288 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLK3P07288 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLK3P07288 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLK3P07288 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLK3P07288 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLK3P07288 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLK3P07288 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLK3P07288 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLK3P07288 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLK3P07288 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLK3P07288 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLK3P07288 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLK3P07288 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLK3P07288 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLK3P07288 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLK3P07288 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLK3P07288 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLK3P07288 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLK3P07288 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLK3P07288 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLK3P07288 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLK3P07288 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLK3P07288 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLK3P07288 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLK3P07288 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLK3P07288 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLK3P07288 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLK3P07288 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLK3P07288 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLK3P07288 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLK3P07288 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLK3P07288 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLK3P07288 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLK3P07288 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLK3P07288 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLK3P07288 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLK3P07288 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLK3P07288 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms